有华夏科研人员协商发掘称,华南海鲜墟市并非新冠病毒起源地
中新社昆明2月22日电据华夏科学院西双版纳热带植物园官方网站音讯,该园连合华南农业大学和北京脑科重心,搜聚了寰球同享到GISAIDEpiFluTM数据库中遮蔽四大洲12个国度的93个新冠病毒模范基因组数据(停止2月12日),经过全基因组数据领会发掘:武汉华南海鲜墟市的新式冠状病毒是从另外处所传入。
图1.新式冠状病毒58种单倍型的衍化关连和地舆散布格局(A,B),单倍型之间的大概衍化关连(C),以及新式冠状病毒的大概传达和分散门径(D)。A和B圆圈中的数据是模范数目。图源:中科院西双版纳热带植物园93个模范包罗58种单倍型,衍化关连显示,单倍型H13和H38是较量“陈旧的”单倍型,经过一此中央载体(mv1,大概是前辈单倍型,也大概是来自中央宿主或“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒RaTG13联系,并经过单倍型H3衍生出单倍型H1。
协商人员称,与华南海鲜墟市相联系的患者样本单倍型都是H1及其衍生单倍型H2,H8-H12,而一份武汉样本单倍型H3与华南海鲜墟市无关。看来,华南海鲜墟市的新冠病毒是从另外处所传入,再在墟市产生疾速传达并曼延。另依据病患病发时候纪录和种群扩大时候猜度,也印证了华南海鲜墟市不是病毒起源地的推广。
另外,协商人员对H13和H38的病毒样本溯源发掘,离别来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例)。他们的观光纪录说明都是年12月终至年1月初在武汉被熏染。现有武汉模范中没有探测到H13和H38单倍型。
图2.新式冠状病毒单倍型的样本收罗时候情状。血色圈的样本是确认与华南海鲜墟市相关;蓝色圈的模范确认与海鲜墟市无关。图源:中科院西双版纳热带植物园协商还显示,新冠病毒在2月12日前产生过2次显然种群扩大:一次是年12月8日,该了局示意病毒大概在12月初,以至11月下旬已开端人际传达,随后在华南海鲜墟市加速;另一次种群扩大产生在1月6日。
图3.个变异位点在8个编码区的散布情状。统计表率囊括更换或代替(左上角),暗号子地方1-3(右上角),同义渐变或非同义渐变(左下角),和氨基酸性质(右下角)。图源:中科院西双版纳热带植物园值得一提的是,为细分来历,协商人员将58种单倍型分红五组,囊括3个陈旧超等传达者单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超等传达者单倍型(H56和mv2)。以此区别出广东的病毒大概有三个来历,重庆和台湾的病毒有两个来历。有较各类本的澳大利亚、法国、日本和美国,患者熏染源最少见两个,特为是美国囊括了五个来历。独特值得
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